MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 81156

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008340	CG	3	6	21891	21896	0 %	0 %	50 %	50 %	114319184
502	NC_008340	GGC	2	6	21980	21985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319184
503	NC_008340	GTC	2	6	21987	21992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319184
504	NC_008340	CAG	2	6	22020	22025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319184
505	NC_008340	ACC	2	6	22027	22032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319184
506	NC_008340	GGT	2	6	22092	22097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319184
507	NC_008340	CCA	2	6	22115	22120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319184
508	NC_008340	GTA	2	6	22125	22130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319184
509	NC_008340	GCC	2	6	22131	22136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319184
510	NC_008340	CGA	2	6	22142	22147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319184
511	NC_008340	TG	3	6	22157	22162	0 %	50 %	50 %	0 %	114319184
512	NC_008340	GCCG	2	8	22163	22170	0 %	0 %	50 %	50 %	114319184
513	NC_008340	TCC	3	9	22171	22179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319184
514	NC_008340	GCC	2	6	22183	22188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319184
515	NC_008340	CGG	2	6	22193	22198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319184
516	NC_008340	CGT	2	6	22241	22246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319184
517	NC_008340	CG	3	6	22249	22254	0 %	0 %	50 %	50 %	114319184
518	NC_008340	CCAG	2	8	22256	22263	25 %	0 %	25 %	50 %	114319184
519	NC_008340	CCA	2	6	22274	22279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319184
520	NC_008340	CCGGC	2	10	22351	22360	0 %	0 %	40 %	60 %	114319184
521	NC_008340	CCG	2	6	22395	22400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319184
522	NC_008340	TCG	2	6	22447	22452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319184
523	NC_008340	TC	3	6	22511	22516	0 %	50 %	0 %	50 %	114319184
524	NC_008340	ATG	2	6	22694	22699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319184
525	NC_008340	CGGG	2	8	22724	22731	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
526	NC_008340	A	6	6	22748	22753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_008340	CGG	2	6	22759	22764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_008340	CGG	2	6	22774	22779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_008340	CAT	2	6	22816	22821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319185
530	NC_008340	GCC	2	6	22822	22827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319185
531	NC_008340	C	6	6	22832	22837	0 %	0 %	0 %	100 %	114319185
532	NC_008340	GCC	2	6	22840	22845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319185
533	NC_008340	ACC	2	6	22849	22854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319185
534	NC_008340	GCC	3	9	22867	22875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319185
535	NC_008340	CGT	3	9	22884	22892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319185
536	NC_008340	GGT	2	6	22921	22926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319185
537	NC_008340	ATC	2	6	22928	22933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319185
538	NC_008340	GGC	2	6	22948	22953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319185
539	NC_008340	TGG	2	6	22980	22985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319185
540	NC_008340	ACC	2	6	23075	23080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319185
541	NC_008340	CAC	2	6	23091	23096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319185
542	NC_008340	GCG	2	6	23137	23142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319185
543	NC_008340	CCT	2	6	23160	23165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319185
544	NC_008340	GAGG	2	8	23194	23201	25 %	0 %	75 %	0 %	114319185
545	NC_008340	GC	3	6	23207	23212	0 %	0 %	50 %	50 %	114319185
546	NC_008340	AGC	2	6	23213	23218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319185
547	NC_008340	CCA	2	6	23225	23230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319185
548	NC_008340	CGCGG	2	10	23254	23263	0 %	0 %	60 %	40 %	114319185
549	NC_008340	TCC	2	6	23279	23284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319185
550	NC_008340	CTT	2	6	23293	23298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319185
551	NC_008340	ATCTCG	2	12	23306	23317	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	114319185
552	NC_008340	TGA	2	6	23334	23339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319185
553	NC_008340	CGC	2	6	23346	23351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319185
554	NC_008340	CAGC	2	8	23352	23359	25 %	0 %	25 %	50 %	114319185
555	NC_008340	CTC	2	6	23407	23412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319185
556	NC_008340	ATG	2	6	23444	23449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319185
557	NC_008340	TCG	2	6	23450	23455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319185
558	NC_008340	CGGC	2	8	23459	23466	0 %	0 %	50 %	50 %	114319185
559	NC_008340	GCC	2	6	23467	23472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319185
560	NC_008340	TGG	2	6	23478	23483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319185
561	NC_008340	CTT	2	6	23506	23511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319185
562	NC_008340	GTC	2	6	23524	23529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319185
563	NC_008340	GCC	2	6	23578	23583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319185
564	NC_008340	GCA	2	6	23604	23609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319185
565	NC_008340	GCG	2	6	23617	23622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319185
566	NC_008340	ACC	2	6	23681	23686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319185
567	NC_008340	GAT	2	6	23722	23727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319185
568	NC_008340	CAG	2	6	23728	23733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319185
569	NC_008340	TTG	2	6	23738	23743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319185
570	NC_008340	CAG	2	6	23761	23766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319185
571	NC_008340	GCA	2	6	23769	23774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319185
572	NC_008340	TCT	2	6	23793	23798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319185
573	NC_008340	GCA	2	6	23805	23810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319185
574	NC_008340	CTG	2	6	23845	23850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319185
575	NC_008340	GTT	2	6	23851	23856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319185
576	NC_008340	TGA	2	6	23946	23951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319185
577	NC_008340	CCTT	2	8	23954	23961	0 %	50 %	0 %	50 %	114319185
578	NC_008340	GAT	2	6	23986	23991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319185
579	NC_008340	TCG	2	6	24005	24010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319185
580	NC_008340	TCG	2	6	24074	24079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319185
581	NC_008340	TGG	2	6	24090	24095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319185
582	NC_008340	CGG	2	6	24147	24152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319185
583	NC_008340	GTG	3	9	24203	24211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319185
584	NC_008340	CTGG	2	8	24235	24242	0 %	25 %	50 %	25 %	114319185
585	NC_008340	GC	3	6	24261	24266	0 %	0 %	50 %	50 %	114319185
586	NC_008340	TCC	2	6	24284	24289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319185
587	NC_008340	CG	3	6	24372	24377	0 %	0 %	50 %	50 %	114319185
588	NC_008340	TCA	2	6	24423	24428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319185
589	NC_008340	GGCG	2	8	24435	24442	0 %	0 %	75 %	25 %	114319185
590	NC_008340	TCG	2	6	24443	24448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319185
591	NC_008340	TG	3	6	24475	24480	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
592	NC_008340	CT	3	6	24486	24491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
593	NC_008340	CGG	2	6	24503	24508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_008340	CGA	2	6	24522	24527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319186
595	NC_008340	CGT	2	6	24537	24542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319186
596	NC_008340	AGC	2	6	24557	24562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319186
597	NC_008340	GCGG	2	8	24636	24643	0 %	0 %	75 %	25 %	114319186
598	NC_008340	CAG	2	6	24658	24663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319186
599	NC_008340	CCA	2	6	24681	24686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319186
600	NC_008340	CGG	3	9	24708	24716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319186
601	NC_008340	CTC	2	6	24751	24756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319186
602	NC_008340	TGA	2	6	24768	24773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319186
603	NC_008340	TCGT	2	8	24834	24841	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
604	NC_008340	GA	3	6	24856	24861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
605	NC_008340	C	6	6	24909	24914	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
606	NC_008340	CGG	2	6	24959	24964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_008340	CCG	2	6	25028	25033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319187
608	NC_008340	GC	3	6	25091	25096	0 %	0 %	50 %	50 %	114319187
609	NC_008340	TGG	2	6	25097	25102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319187
610	NC_008340	GCC	2	6	25114	25119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319187
611	NC_008340	GACT	2	8	25139	25146	25 %	25 %	25 %	25 %	114319187
612	NC_008340	CTG	2	6	25195	25200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319187
613	NC_008340	CGG	2	6	25211	25216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319187
614	NC_008340	AGC	2	6	25250	25255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319187
615	NC_008340	CGGG	2	8	25340	25347	0 %	0 %	75 %	25 %	114319187
616	NC_008340	ACG	2	6	25358	25363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319187
617	NC_008340	GCT	2	6	25467	25472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319188
618	NC_008340	TGC	2	6	25478	25483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319188
619	NC_008340	GC	4	8	25510	25517	0 %	0 %	50 %	50 %	114319188
620	NC_008340	CAG	2	6	25546	25551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319188
621	NC_008340	TCC	2	6	25556	25561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319188
622	NC_008340	GAG	2	6	25567	25572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319188
623	NC_008340	CTG	3	9	25612	25620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319188
624	NC_008340	CTA	2	6	25641	25646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319188
625	NC_008340	CGG	2	6	25683	25688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319188
626	NC_008340	GAC	2	6	25732	25737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319188
627	NC_008340	CTT	2	6	25740	25745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319188
628	NC_008340	ACC	2	6	25753	25758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319188
629	NC_008340	TCC	2	6	25760	25765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319188
630	NC_008340	GCG	2	6	25766	25771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319188
631	NC_008340	CGA	2	6	25809	25814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319188
632	NC_008340	CCG	2	6	25877	25882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319188
633	NC_008340	GTG	2	6	25916	25921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319188
634	NC_008340	CGG	3	9	25923	25931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319188
635	NC_008340	GGC	2	6	25933	25938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319188
636	NC_008340	CGGC	2	8	25943	25950	0 %	0 %	50 %	50 %	114319188
637	NC_008340	GAT	2	6	25998	26003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319188
638	NC_008340	CTT	2	6	26013	26018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319188
639	NC_008340	GCT	3	9	26028	26036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319188
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641	NC_008340	GCGG	2	8	26111	26118	0 %	0 %	75 %	25 %	114319188
642	NC_008340	GCT	3	9	26121	26129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319188
643	NC_008340	CT	3	6	26128	26133	0 %	50 %	0 %	50 %	114319188
644	NC_008340	CGG	2	6	26183	26188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319188
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646	NC_008340	CGC	2	6	26341	26346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319188
647	NC_008340	GGGC	2	8	26352	26359	0 %	0 %	75 %	25 %	114319188
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650	NC_008340	CGC	2	6	26433	26438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319188
651	NC_008340	ACC	2	6	26455	26460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319188
652	NC_008340	GGTC	2	8	26466	26473	0 %	25 %	50 %	25 %	114319188
653	NC_008340	GGCGCT	2	12	26478	26489	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114319188
654	NC_008340	GCT	3	9	26520	26528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319188
655	NC_008340	CCG	3	9	26537	26545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319188
656	NC_008340	TGGA	2	8	26572	26579	25 %	25 %	50 %	0 %	114319188
657	NC_008340	TGC	2	6	26606	26611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319188
658	NC_008340	GAT	2	6	26628	26633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319188
659	NC_008340	GCCCTC	2	12	26659	26670	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	114319188
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661	NC_008340	GCT	2	6	26730	26735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319188
662	NC_008340	GGC	2	6	26766	26771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319188
663	NC_008340	GCT	2	6	26772	26777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319188
664	NC_008340	GCC	3	9	26785	26793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319188
665	NC_008340	TGG	2	6	26795	26800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319188
666	NC_008340	TCAGC	2	10	26820	26829	20 %	20 %	20 %	40 %	114319188
667	NC_008340	CGGA	2	8	26860	26867	25 %	0 %	50 %	25 %	114319188
668	NC_008340	GCAGGC	2	12	26919	26930	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114319188
669	NC_008340	GCCG	2	8	26936	26943	0 %	0 %	50 %	50 %	114319188
670	NC_008340	GGACC	2	10	26994	27003	20 %	0 %	40 %	40 %	114319188
671	NC_008340	GGC	2	6	27024	27029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319188
672	NC_008340	GC	4	8	27084	27091	0 %	0 %	50 %	50 %	114319188
673	NC_008340	CAT	2	6	27126	27131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319188
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677	NC_008340	CTG	2	6	27261	27266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319189
678	NC_008340	GGT	2	6	27272	27277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319189
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682	NC_008340	GAG	2	6	27456	27461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319189
683	NC_008340	CCGG	2	8	27533	27540	0 %	0 %	50 %	50 %	114319189
684	NC_008340	TCG	2	6	27556	27561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319189
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687	NC_008340	CCCTG	2	10	27646	27655	0 %	20 %	20 %	60 %	114319189
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691	NC_008340	CGA	2	6	27802	27807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
692	NC_008340	ACA	3	9	27813	27821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
693	NC_008340	GCG	2	6	27841	27846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
694	NC_008340	TGT	2	6	27848	27853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
695	NC_008340	CTG	2	6	27889	27894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319190
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717	NC_008340	TGCC	2	8	28878	28885	0 %	25 %	25 %	50 %	114319192
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722	NC_008340	CAT	2	6	29016	29021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319192
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729	NC_008340	GGC	4	12	29308	29319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319192
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737	NC_008340	G	6	6	29630	29635	0 %	0 %	100 %	0 %	114319192
738	NC_008340	TTC	2	6	29674	29679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319192
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741	NC_008340	AGG	2	6	29795	29800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319192
742	NC_008340	CGGG	2	8	29900	29907	0 %	0 %	75 %	25 %	114319192
743	NC_008340	GCC	2	6	29952	29957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319192
744	NC_008340	CTA	2	6	29958	29963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319192
745	NC_008340	CG	3	6	30018	30023	0 %	0 %	50 %	50 %	114319192
746	NC_008340	GGT	2	6	30045	30050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319192
747	NC_008340	CAT	2	6	30090	30095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319192
748	NC_008340	AAG	2	6	30145	30150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319192
749	NC_008340	GAG	2	6	30202	30207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
750	NC_008340	CCG	2	6	30250	30255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319193
751	NC_008340	TGA	2	6	30296	30301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319193
752	NC_008340	GCCG	2	8	30326	30333	0 %	0 %	50 %	50 %	114319193
753	NC_008340	GCCA	2	8	30348	30355	25 %	0 %	25 %	50 %	114319193
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755	NC_008340	CGG	2	6	30485	30490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319193
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